La vacuola del alga es una cavidad llena de liquido que ocupa el 90% del volumen total. El citoplasma es así comprimido contra la pared celular y el tonoplasto. (membrana que rodea la vacuola)

La vacuola contiene una reserva de iones, azucares, vitaminas etc. A menudo se encuentran cristales de almidón en el interior. La alta concentración de iones permite la absorción de agua por osmosis para mantener la presión de turgencia que garantiza la rigidez del tejido y da la forma del alga.